手术室净化从工程开始就需要有洁净技术方面的专家参与，专家既熟悉的医院净化发展方向，又有丰富且的经验，可使得层流手术室建设项目，在规划和设计时就能做到高起点、少走弯路，不留遗憾。
要做好手术室净化，就需要在方案设计论证时能保持功能合理，有足够的层高，层面设备部位承重等合理设计。在土建施工时应该预留洞口、预埋工作、防水层施工等工作。总包单位安装施工时应进行总体的科学规划，统筹安排各承包单位、其他配合单位。

合理设计是实现层流手术室建筑节能的主要途径。设计方的设计图纸深度要具备施工要求。医院层流手术室设计先是工艺设计，医院建筑与普通民用建筑，存在的区别就是医院功能复杂、流线复杂。层流手术室设计先是工艺设计，然后才是建筑设计。符合洁净规范要求的、布局合理的平面布局确定后，再进行洁净空调、装饰装修、医用气体、电气、给排水等设计，满足功能需求、方便，是一名设计师要考虑的问题。